國家發展與中國大陸研究所前身為中山學術研究所及中國大陸研究所，中山學術研究所，於民國五十一年本校創辦時之初即已設立時名「三民主義研究所」，歷任所長為張其昀教授、曾虛白教授、朱秉義教授、唐振楚教授、傅宗懋教授、楊逢泰教授、周陽山教授、曹俊漢教授、葉明德教授。中國大陸研究所原名大陸問題研究所，為國內第一所以「大陸問題」為名之研究所，歷任所長為葉翔之教授(時任本校校長)、項迺光教授，民國78年更名為「中國大陸研究所」，歷任所長為雷飛龍教授、楊開煌教授、高輝教授、唐彥博教授、李炳南教授、邵宗海教授、趙建民教授。前述兩所於民國98年8月合併並更名為中山與中國大陸研究所，於105年度更名為國家發展與中國大陸研究所，目前由李孔智教授擔任所長。